やはりPMCで公開すべきです

今まで、J-stageにアップすると自動的にPubMedに掲載されてましたが、PubMedから電子ジャーナルについてPMC (= PubMed Central) に全文を掲載することをPubMed掲載の条件とすると通告されました。

調べてみると

NLM(米国国立医学図書館)は、電子ジャーナルのみで公開しているPubMed 収録誌の発行機関宛てに「PMC」「Portic」「CLOCKSS」の何れかで登載するように通達しており、この中にJ-STAGEは含まれていません。

言い換えれば、J-STAGEは、NLM から電子ジャーナルプラットフォームとは位置付けてされていないようです。
英語論文ならJ-STAGEだけでは発信力が弱いので、PMCでも公開することをお薦めします。